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畜牧与动物医学论文_基于RNA-Seq数据分析油酸
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摘要:文章摘要:试验旨在探讨PPARγ的天然配体油酸对延边牛前体脂肪细胞分化及脂代谢的影响及调控机制,利用100 μmol/L油酸对细胞进行诱导分化,通过RNA-Seq技术对分化后48h和96h的细胞进行转
文章摘要:试验旨在探讨PPARγ的天然配体油酸对延边牛前体脂肪细胞分化及脂代谢的影响及调控机制,利用100 μmol/L油酸对细胞进行诱导分化,通过RNA-Seq技术对分化后48h和96h的细胞进行转录组测序,对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果表明:与分化48 h时相比,分化96 h时差异表达基因数量增加3519个,差异表达基因的分子功能,参与的生物过程和细胞组成随分化时间不同均发生变化,生化代谢途径和信号转导途径也差异较大;由PPAR信号通路的分析结果可以得出,分化48h时,PPARγ的表达上调,信号通路成员PLIN2、CPT1β,SREBP1、FABP4上调,SCD表达下调;分化96 h时,PLIN2、SREBP1、CPT1β显著上调,PPARγ、SCD的表达显著下调,FABP4表达无显著变化。说明油酸对延边牛前体脂肪细胞分化过程中的转录组学及信号通路存在一定影响。
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